维摩大士问文殊菩萨何为佛种。文殊菩萨的所答超乎寻常，并没有说当发菩提心、四弘誓愿、六度万行等等才是佛种，而是说“身见”是佛种，又说无明、贪爱、四颠倒、十不善业等等，总之所有烦恼，皆是佛种。甚至连维摩大士都觉得这种说法十分令人诧异，文殊菩萨应机开示了所以然。

如果已经入无为涅槃的二乘行者，实际情况是再也不能发起菩提心，文殊菩萨作了一个贴切的比喻，犹如高原陆地虽然肥沃广阔，反而绝对生不出莲华，酸臭潮湿的淤泥中，才是养育莲花的天然环境一样，在众生烦恼海中，才能长养佛种、成就佛道。下海下得越深广，所得的财富越珍贵。

大迦叶听闻此法非常感叹，觉得他们声闻不发成佛之心，犹如焦芽败种，失去成佛的机会，从根性而言还不如五无间罪的众生，依然有种佛种的可能。实际上我们常听到“执着我见如须弥山”，佛都可以接受，“执着空见如芥子大”，佛绝不允许，也是讲的这个道理；二乘如而不来，故永远不能“如来”，凡夫来而不如，还能下如来种，也是讲这个道理；罗汉灰身灭智，菩萨入世度生，也是讲这个道理。尘劳烦恼处，才好种如来种。这也是“佛法在世间，不离世间觉”的真义。